Военный переворот в России, с которым мы столкнулись в оригинальной игре Ghost Recon, вызвал цепную реакцию локальных войн по всему миру. Беда не обошла стороной и африканский континент, где разгорелось всепожирающим огнем, притухшее было противостояние между Эфиопией и Эритреей. Эфиопские войска, ведомые полковником Тесфаем Уольде, вторгаются на территорию соседа. По просьбе правительства Эритреи и в целях предотвращения гуманитарного кризиса в противостояние вмешивается мировое сообщество. И снова "Призраки" становятся той силой, которая урегулирует конфликт. Любой ценой.